SARS-COV-2-Diagnostik

Durch die Entstehung und Ausbreitung neuer Virusvarianten besteht weiterhin Bedarf an Produkten und Dienstleistungen zur Covid-19-Detektion. Für einen erfolgreichen Nachweis von aufkommenden SARS-CoV-2-Mutanten ist die effiziente Aufreinigung von Virus-RNA aus Patientenproben, Abwasser oder von Oberflächen erforderlich. Entscheidend dabei ist nicht nur die Verlässlichkeit des verwendeten Kits zur Nukleinsäure-Extraktion, sondern auch die Konservierung der Probe mit einem Stabilisierungsreagenz, was dafür sorgt, dass das Virus-Erbgut vom Zeitpunkt der Probennahme bis zur nachgeschalteten Aufreinigung und Analyse intakt bleibt.

Sichere Probennahme

Ein wichtiger Aspekt bei der Entnahme von potentiell infektiösem Probenmaterial ist die Sicherheit der Mitarbeiter im Gesundheitswesen und im Labor. Das DNA/RNA Shield™-Reagenz inaktiviert SARS-CoV-2 vollständig, wodurch die Probe sicher gehandhabt, kosteneffizient transportiert und unproblematisch gelagert werden kann. Bei Raumtemperatur bleibt die Virus-RNA im Shield-Reagenz für einen ­Monat stabil, was das Risiko einer Fehlbewertung von Proben, auch bei Auftreten von Verzögerungen, minimiert und eine robuste Analyse ermöglicht. Speziell für die sichere Probennahme durch Laien von zu Hause aus, hat Zymo Research die SafeCollect™-Linie ent­wickelt. Die Probenentnahmeröhrchen sind mit DNA/RNA Shield™ gefüllt, um die Integrität der Probe zu garantieren, und verfügen über eine Sicherheitsmembran, welche ein unbeabsichtigtes ­Verschütten, Berühren und/oder Verschlucken des Reagenzes verhindert.

COVID-19 NGS-Workflow

Der komplette Workflow zur Detek­tion von SARS-CoV-2 umfasst die sichere Probenentnahme mit den DNA/RNA Shield™-Probengefäßen, die automatisierte RNA-Extraktion im Hochdurchsatz mit Hilfe des Quick-DNA/RNATM ­Viral MagBead-Kits sowie den sensitiven ­Virusnachweis mittels Quick SARS-CoV-2 Multiplex-Kit. Diese Produkte von Zymo Research sind CE-IVD-zertifiziert und mit allen offenen Automatisierungsplattformen kompatibel. Skripte und Anleitungen stehen bereits für diverse Geräte zur Verfügung oder können individuell angepasst werden. Die isolierte virale RNA kann anschließend per Next Generation Sequencing analysiert werden. Auch die Firma Illumina empfiehlt die Verwendung des Extraktions-Kits in ihrem COVIDSeq™-Workflow. Zusätzlich hat Zymo ein molekularbiologisches Abwassermonitoring etabliert, das die Verfolgung neuer besorgniserregender SARS-CoV-2-Varianten im Abwasser frühzeitig ermöglicht.

Dieser Gastbeitrag ist im |transkript-Spezial Laborwelt zum Thema Diagnostik erschienen.